HiSeq过气, NovaSeq登场! Illumina NovaSeq速览

HiSeq过气, NovaSeq登场! Illumina NovaSeq速览

在HiSeq之后,Illumina公司宣布了全新的NovaSeq 测序系统,NovaSeq的登场完全打乱现有的HiSeq的用户市场。 如果你是一个HiSeq用户,而且没有升级到NovaSeq的计划,那你很有可能会在1-2年的时间内被市场淘汰。NovaSeq的登场虽然不是HiSeqs的丧钟,但是很类似了。如果你的业务时基于Illumina平台的设备,那么在接下来的几年里,用户从HiSeq迁移到NovaSeq是市场唯一可行的选择。正如之前的各种Illumina平台也一样,Illumina也这样做过。

下表是一些统计数据, 一共有两种 NovaSeq 测序仪,型号为5000 和 6000 ,对应4种flowcell 类型 – S1, S2, S3 and S4。6000 运行了所有的4个flowcell , 5000 只运行了前2个。不是所有的 flowcell 都是可用的,  S4 计划在2018年公布。

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对于Hiseq X Ten, 可以简单的将X 的数据乘以 10.

NovaSeq 的读长是 2×50, 2×100 和 2x150bp.  不过目前RNA-Seq 和 exomes 测序用的是 2x75bp.

正如从上面的统计数据中看到的,NovaSeq的lane密度大大增加,这也极大地增加了数据产出。然而却有更短的运行时间。

这意味着什么呢?

目前看来HiSeq还是有优势的,但是,仅限于2018年前S4 flowcell上市前。目前HiSeq还是还是建立测序中心和大规模基因测序的最便宜平台。但是Illumina不会销售更多的HiSeq平台。

根据某匿名来源的人士,我们得到了如下的消息:

speculation from Illumina rep “X’s will be king for awhile. Cost per GB on those will likely be adjusted to keep them competitive for a long time.”

也就是说,Illumina正打算降低HiSeq的测序成本。HiSeq的优势还能领先一会会儿,暂时!!

由于原文文字太多,新科学就不完全翻译了,如果想查看更多的内容,可以查看原文

本文原文:http://www.opiniomics.org/hiseq-move-over-here-comes-nova-a-first-look-at-illumina-novaseq/

 

 

测序百家,转转请注明出处:https://www.ngsgo.com/archives/109.html

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