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基因测序市场上Pacbio推出小型单分子测序仪:Sequel

2015年初,美国总统奥巴马发布的“精准医学”计划,掀起一个以基因测序为基础的精准医学热潮,特别是在大洋彼岸的中国,其火热程度甚至超过了美国,不同的精准医学计划发布,精准医学机构成立,创业公司也都宣称自己要做精准医学,但大部分都是用概念包装了一下原来的业务,更新了一下思维,其实质性改变并不大。
基因测序市场上Pacbio推出小型单分子测序仪:Sequel

Sequel系统工作界面

作为精准医学的基础,基因测序是最核心的技术,同时还必须把基因数据与临床数据、健康数据、生活数据,甚至环境数据整合起来。基因测序技术本身在不断的变化中,从一代Sanger法测序,到目前主流的二代高通量测序,用了将近40年的时间,第三代的单分子基因测序技术目前还处于早期,但测序的片段很长,优势明显。

在我们以前的分享中,曾经猜测过Pacbio可能正在研发小型的单分子测序仪,现有的PacBio RS II太重:860公斤,没有好的楼板承受力,是不能贸然做为实验室的,还太大:203 cm x 90 cm x 160 cm。当然,也比较贵,通量也比较低。美国公司发布新的技术或设备,一般都选择行业内很重要的会议或者在年初的JP摩根医疗投融资大会上,借以扩大市场宣传。Pacbio这次推出的Sequel单分子测序仪在体积和仪器价格上都基本降到了原来的三分之一,但由于重新设计了反应cell,通量居然比原来的大仪器提高了7倍……,请容我缓一缓,7倍是什么概念,PacBio RS II一个cell用最新的试剂可以产出1Gb的数据,而Sequel则把通量提高到了7Gb,相当于可以测2.3X的人类基因组了,假以时日,其长读长、随机错误和直测表观的优势会表现的愈发明显。

相对HiSeq X的1.8Tb的数据产量,Sequel相差还有250倍的距离,性价比仍然需要大幅提升。大家表兴奋太早,由于PacBio早早就与Roche签订了委身契约,Sequel会优先发货给Roche开展临床方面的研究开发,而且是独家的临床合作伙伴儿,像国内最近接二连三发布战略合作伙伴儿的事情估计会较少看到了,但在科研领域会产生不少的影响。Sequel产生后冲击比较大的会是10X Genomics,这个以宣称做长片段基因测序的公司,同时对英国NanoPore纳米孔单分子测序也会产生一定压力,这个技术刚刚开始商业化,而PacBio已经开始加速。

PacBio还会继续为其PacBio RS II提供服务,但其会不会继续提升PacBio RS II的通量值得观察。这次的ASHG年会上,PacBio会详细介绍Sequel,那么在明年初的JP摩根医疗投融资大会上,PacBio RS II是否为变成更高通量的平台是一个观察时间点。

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